Mohammed Abdellaoue og hans lagkamerater jaktet viktige poeng i storkampen mot den suverene serielederen og tok ledelsen ved Vedad Ibisevic i første omgang. Moa var nest sist på ballen.
Bayern framsto ikke i sin beste utgave uten skadde Arjen Robben og Franck Ribéry, men Claudio Pizarro greide å utligne i det 76. minutt, da han nikket Thiagos frispark i mål.
På overtid avgjorde Thiago med sitt kunstmål. Rafinhas innlegg ble møtt med et sykkelspark som ikke levnet keeper Sven Ulreich noen sjanse.
– Det var en heldig seier. Vi var ikke like gode som vanlig, men vi viste at vi kan score mål i avgjørende øyeblikk, sa Bayern-kaptein Philipp Lahm.
– Vi spilte godt og fortjente minst ett poeng, sa Stuttgart-trener Thomas Schneider. (©NTB)